在处理微污染水源水时，纤维球过滤器与其他处理工艺协同使用能显著提升净化效果。 与生物预处理工艺协同是常见且有效的方式。例如生物接触氧化法，在纤维球过滤器前端设置生物接触氧化池，池中填充有生物填料，微生物在填料表面生长繁殖形成生物膜。微污染水源水先流经生物接触氧化池，水中的有机污染物、氨氮等在微生物的作用下被分解转化为无害物质，降低了后续纤维球过滤器的处理负荷。纤维球过滤器则进一步去除生物处理后水中残留的悬浮物、胶体等杂质，两者协同，既能有效去除污染物，又能保证出水水质的清澈度。
与活性炭吸附工艺结合也十分有效。活性炭具有巨大的比表面积和丰富的微孔结构，对水中的有机物、重金属离子以及部分微生物等有很强的吸附能力。在纤维球过滤器后串联活性炭吸附装置，经过纤维球过滤的水再进入活性炭吸附柱。活性炭可吸附水中残留的微量有机污染物、色素、异味物质等，进一步提升水质。同时，活性炭表面的微生物也能对部分污染物进行降解，与纤维球过滤器的物理过滤作用相互补充，使处理后的水在有机物去除、水质口感等方面都能达到更高标准。
此外，还可与膜过滤工艺协同。超滤膜能有效去除水中的细菌、病毒、大分子有机物以及胶体等杂质，过滤精度高。将纤维球过滤器作为超滤膜的预处理工艺，先通过纤维球过滤器去除大部分悬浮物和较大颗粒杂质，减轻超滤膜的污染负荷，延长超滤膜的使用寿命。超滤膜再对纤维球过滤后的水进行深度处理，实现对微污染水源水的高效净化，满足对水质要求极高的应用场景，如高端饮用水制备等。
