纤维球过滤器的过滤性能受纤维球的装填方式的影响。传统的装填方式可能导致纤维球分布不均匀，部分区域纤维球过于密集，而部分区域则较为稀疏，这会使得水流通过滤层时出现短路或偏流现象，降低过滤效率和效果。
一种优化的装填方式是采用分层装填法。首先在过滤器底部铺设一层粒径较大、强度较高的纤维球，这一层主要起到支撑作用，能承受水流的冲击，防止下层纤维球因受压而过于紧实。然后，逐渐向上装填粒径逐渐减小的纤维球。较小粒径的纤维球能形成更细密的孔隙结构，对水中细微杂质的截留能力更强。通过这种分层装填，构建出一个孔隙上疏下密的滤层结构，与水流过滤方向相匹配，水流先经过上层较大孔隙初步去除大颗粒杂质，再通过下层细密孔隙拦截微小颗粒，从而提高整体过滤精度。
另一种方式是采用预压缩装填法。在装填纤维球前，对纤维球进行适度压缩，使其体积变小。然后将压缩后的纤维球紧密装填到过滤器中，装填完成后，再通过反冲洗等方式使其恢复自然松散状态。这样做可以保证纤维球在过滤器内分布更加均匀，减少空隙和偏流现象。而且，经过预压缩的纤维球在恢复过程中，会相互交织得更加紧密，形成更稳定的孔隙结构，增强对杂质的截留能力。同时，在装填过程中，可以借助一些辅助工具，如振动装置，在装填时对过滤器进行轻微振动，促使纤维球在重力和振动作用下更紧密、均匀地排列，进一步优化装填效果。
